畸形兒產(chǎn)生的內(nèi)因主要是遺傳。這是由來自父母親的遺傳物質的異常而造成的。人體內(nèi)的遺傳物質存在于細胞核內(nèi)的染色體上。通常染色體是穩(wěn)定的，但在日常生活中一些不良因素(如放射線、藥物、疾病，被污染的水、空氣等)的影響下，染色體的數(shù)目、結構可發(fā)生異常，而染色體上的一個或多個基因(決定遺傳性狀的功能單位)發(fā)生了突變，則可造成畸胎。
近親結婚嚴重影響優(yōu)生。某些遺傳性疾病，致病基因是隱性的，只有當夫婦雙方都攜帶這種隱性基因且結合時，后代才明顯發(fā)病。非近親婚配時，兩個相同致病基因互相遇合而引起發(fā)病的可能性較低，而近親結婚的夫婦，由于他們的基因來自同一祖先，雙方攜帶有相同致病基因的可能性明顯大于一般群體，子女中某些遺傳性疾病的發(fā)病率就遠遠高于非近親結婚者所生的孩子，因此近親之間應禁止通婚。
